2024年4月2日，波士顿儿童医院的研究人员在Cell上发表了题为Charting the cellular biogeography in colitis reveals fibroblast trajectories and coordinated spatial remodeling的文章。
本研究利用MERFISH技术分析了小鼠结肠中的135万个细胞、940个基因的表达谱，揭示了结肠炎和恢复过程中的细胞和空间重塑；确定了健康细胞群和炎症相关细胞群的多样性，绘制了它们的空间组织，并揭示了它们在炎症中的极化或招募，炎症相关成纤维细胞（IAF）反应比预期更加多样化；基于细胞群的空间组织特点，定义了25个细胞邻域（neighborhood），并揭示了这些邻域在肠道炎症不同阶段的进展性演变，这种组织重塑一定程度上是由多种IAF定义的，它们具有独特的表达谱、空间定位、细胞间互作和健康成纤维细胞起源；在人类溃疡性结肠炎中发现了类似的特征，表明这些过程在人类中可能是保守的。
