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《中国研究团队在云南蝙蝠中发现全新冠状病毒，具有感染人类的潜力》

  • 来源专题：生物安全
  • 编译者： 闫亚飞
  • 发布时间：2022-12-23

  • 据生命科学前沿公众号11月26日消息，中山大学医学院研究团队利用宏转录组的方法系统探索了栖息在云南6个县/市的蝙蝠的病毒组，发现并评估了41种哺乳动物相关的病毒，包括32种RNA病毒，覆盖11个病毒科。呼肠孤病毒科（27.5%）、小RNA病毒科（12.1%）、冠状病毒科（8.7%）分列携带率前三名，其中包含一种与SARS-CoV-2和SARS-CoV均密切相关的新型重组SARS-like冠状病毒，其受体结合域序列与SARS-CoV-2最早的序列之间只有5个氨基酸差异。功能分析预测该重组冠状病毒可利用人ACE2受体，具有较高的人畜共患风险。



  • 原文来源：https://mp.weixin.qq.com/s/xhz32F35AVJiRGYrOwHApQ
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相关报告

  • 《Nat Commun：令人担忧！从蝙蝠中分离出的丝状病毒LLOV有潜力感染人类细胞》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2022-05-09
    • 在一项新的研究中，来自匈牙利佩奇大学等研究机构的研究人员从匈牙利施赖伯蝙蝠（Schreiber's bat）中分离出Lloviu病毒（LLOV），鉴于LLOV与埃博拉病毒存在着密切的亲缘关系，这凸显了未来研究的必要性，以确保防备下一次大流行病。相关研究结果发表在Nature Communications期刊上，论文标题为“Isolation of infectious Lloviu virus from Schreiber’s bats in Hungary”。 LLOV是包括埃博拉病毒在内的丝状病毒科的一部分。虽然埃博拉病毒（和包括类似的致病性马尔堡病毒在内的其他丝状病毒）只在非洲自然发生，但LLOV在欧洲也被发现。丝状病毒LLOV于2002年通过它的遗传物质（RNA）在西班牙的施赖伯蝙蝠中被发现，随后在匈牙利的蝙蝠中被发现。 作为一种人畜共患病毒---在动物和人类之间传播的病毒，LLOV引起了全世界公共卫生的关注，因为我们在农业和自然环境中与动物有着密切的关系。近年来，随着许多野生动物的自然栖息地不断被破坏和侵占，情况更是如此。世界卫生组织（WHO）指出，“人畜共患病在所有新发现的传染病以及许多现有的传染病中占有很大比例。” 这些作者参与了使用蝙蝠血清进行的所有抗体检测实验，即便在这种病毒本身被分离出来之前，也是如此。这种LLOV病毒分离是从最后一只检测出LLOV阳性的蝙蝠身上开展的，而且是在匈牙利国家病毒学实验室进行的。 重要的是，这些作者如今发现LLOV有潜力感染人类细胞，而且也有潜力进行病毒复制。这引起了在欧洲发生潜在广泛传播的担忧，并敦促立即进行致病性和抗病毒研究。他们还发现LLOV和埃博拉病毒之间没有抗体交叉反应，这表明如果LLOV被传染给人类，现有的埃博拉疫苗可能无法防止它。 这些作者表示，他们的“研究提供了确凿的证据。我们既要更多地了解这种病毒的分布情况，又要在这个领域开展研究以评估它的风险，并确保我们为潜在的流行病和大流行病做好准备，这一点至关重要。” 从这项研究中可以看出，关于这些新发现的病毒的致病性、动物宿主和传播性，存在着相当大的知识差距。基于此，欧洲蝙蝠病毒学家联盟旨在欧洲范围内对LLOV对人类的风险进行必要的进一步研究，此外还包括以蝙蝠为宿主的冠状病毒和狂犬病毒（狂犬病）等其他病毒家族。 参考资料： 1. Gábor Kemenesi et al. Isolation of infectious Lloviu virus from Schreiber’s bats in Hungary. Nature Communications, 2022, doi:10.1038/s41467-022-29298-1. 2. Lloviu virus—a possible new pandemic threat—isolated for the first time https://medicalxpress.com/news/2022-05-lloviu-virusa-pandemic-threatisolated.html
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  • 《Nature头条：日本和柬埔寨发现与新冠密切相关的冠状病毒！》
    • 来源专题：中国科学院病毒学领域知识资源中心
    • 编译者：malili
    • 发布时间：2020-12-02
    • 再过一个月，就是新冠大流行暴发一周年了。截止到今天，全球已有58425681人感染，已有1385218人因新冠肺炎死亡。 病毒的源头虽然还未查明，但溯源工作一直在进行着。 北京时间11月24日，《Nature》头条新闻发布关于新冠病毒溯源工作的最新消息。 柬埔寨的一个研究团队在一个冷藏箱里的蝙蝠中发现了一种与SARS-CoV-2（新冠病毒）密切相关的冠状病毒。与此同时，日本的一个研究团队报告称，他们也在冷冻的蝙蝠粪便中发现了另一种密切相关的冠状病毒。 上述两种病毒是在中国以外发现的首个已知的新冠病毒近亲，这为世界卫生组织在亚洲各地寻找新冠大流行的动物来源提供了支持。强有力的证据表明，新冠病毒起源于蝙蝠，但它是直接从蝙蝠跨种传播给人类，还是通过中间宿主传播的，仍然是个谜。 2010年在柬埔寨北部捕获的两只shameli菊头蝠（Rhinolophus shameli）中发现了这种病毒。该病毒的基因组还没有完成测序，这项发现也没有被发表，因此很难确定它对大流行的全部意义。 柬埔寨巴斯德研究所的病毒学家Veasna Duong说，如果这种病毒与导致大流行的新冠病毒有非常密切的联系，甚至是它的祖先，那么它可以提供关于新冠病毒如何从蝙蝠传给人类的重要信息，并有助于寻找大流行的源头。Duong领导了柬埔寨的样本搜索，并于11月初提交给《Nature》杂志。研究人员说，要提供这样的见解，该病毒必须与新冠病毒共享97%以上的基因组。 法国巴斯德研究所的病毒学家Etienne Simon Loriere说，但这种新病毒的关系可能更为疏远，在这种情况下，对它的研究将有助于科学家们更多地了解冠状病毒家族的多样性。他计划对病毒进行测序，然后将其公开分享。 日本研究团队曾在2013年捕获的一只角菊头蝠（Rhinolophus cornutus）中发现的另一种病毒Rc-o319就是这种情况。澳大利亚悉尼大学的病毒学家Edward Holmes说，根据11月2日发表的一篇论文，这种病毒与新冠病毒只有81%的共享基因组，这使我们很难深入了解大流行的起源。 越南野生动物保护协会的进化生物学家Alice Latine说，无论柬埔寨的研究团队发现的是什么，这两项新发现都令人兴奋，因为它们证实了与新冠病毒密切相关的病毒在角菊头蝠中也相对常见，甚至在中国境外发现的蝙蝠中也是如此。世卫组织看过柬埔寨研究团队的一些分析，但没有参与调查。 Duong说：“这就是我们要找的。这既令人兴奋又令人惊讶。” 大流行的起源 浙江大学爱丁堡大学联合学院传染病专家Aaron Irving说：“这些发现还表明，其他尚未被发现的与新冠病毒有亲缘关系的病毒可能会被储存在实验室的冰箱里。他计划对储存的蝙蝠和其他哺乳动物样本进行新冠病毒抗体检测。 东京大学的病毒学家Shin Murakami说：“我没想到会找到新冠病毒的近亲。”Murakami是在新冠大流行之后决定重新检测冷冻动物样本中病毒的研究团队成员。 只有少数已知的冠状病毒与新冠病毒密切相关，包括已知最接近的RaTG13。它于2013年在中国云南的中华菊头蝠（Rhinolophus affinis）中发现，该研究于今年早些时候已经发表。在2015年至2019年间捕获的其他角菊头蝠和穿山甲中也发现了其他几种冠状病毒。科学家现在知道这些病毒与新冠病毒密切相关。 参与柬埔寨研究团队的美国加州大学戴维斯分校健康研究所副所长Tracey Goldstein说：“新冠病毒可能不是一种突然冒出来的全新病毒。这组病毒在我们2019年意识到它们之前可能就已经存在了。” Latinne说，这些发现证实了角菊头蝠是这些病毒的宿主。 柬埔寨的病毒 作为美国政府资助的“PREDICT”项目的一部分，Duong的团队在柬埔寨捕获了Shamel菊头蝠。PREDICT项目对世界各地的野生动物进行了数十年的跟踪调查，以寻找可能引发大流行的病毒，但于今年早些时候被特朗普政府终止。今年4月，美国国际开发署向该项目追加了300万美元，并延长了6个月，以在老挝、马来西亚、尼泊尔、泰国、越南和柬埔寨的实验室冰箱中寻找动物样本（主要是蝙蝠、穿山甲和其他动物）中发现新冠病毒的证据。这些调查的完整报告预计将在未来几周公布。 Duong说，对新蝙蝠病毒的一个短片段（324个碱基对）的初步基因组测序显示，它与新冠病毒和RaTG-13的的同一区域相似，表明这三个病毒是密切相关的。 Latinne说，这个区域在冠状病毒中高度保守，经常被用来快速识别病毒是新的还是已知的。但目前还不清楚究竟是RaTG-13病毒还是新病毒与新冠病毒的关系更为密切。 同样在柬埔寨巴斯德研究所工作的病毒学家Vibol Hul说，很难用这么小的片段来说明，大多数已知冠状病毒的基因组包含约3万个碱基对。Hul曾于2010年在一个洞穴的入口处捕获过Shamel菊头蝠。 柬埔寨巴斯德研究所的病毒学家Erik Karlsson表示，在另一项分析中，他们使用当地可用的技术对新病毒基因组的约70％进行了测序。该序列缺少有关病毒关键部分的信息，例如编码冠状病毒通常用于进入细胞的刺突蛋白（S蛋白）的基因。Duong说，对该部分进行测序将表明该病毒是否可以感染人类细胞。 Irving说，新病毒必须与新冠病毒至少有99%的相似度，才能成为当前大流行病毒的直接祖先。RaTG13和新冠病毒的基因组仅有4%的差异，表明它们拥有共同的祖先，但这种差异也代表了40至70年的进化过程。虽然相隔数十年，但这两种病毒非常相似，可以使用相同的受体进入细胞。细胞研究表明，RaTG13可以感染人类。 另一个近亲 Duong说，在已知与新冠病毒相关的冠状病毒中，新发现的Rc-o319似乎是关系最远的。 在细胞研究中，日本研究团队发现这种病毒不能与新冠病毒用来进入人体细胞的受体结合，这表明它不容易感染人。 Shin说，他的同事今年早些时候在日本捕获了更多的蝙蝠，并计划对它们进行冠状病毒检测。今年10月的时候，Hul回到柬埔寨北部的洞穴去捕捉更多的蝙蝠。 Holmes说：“生活在该地区的角菊头蝠种群中可能存在更多与新冠病毒相关的冠状病毒。希望其中一个或多个与新冠病毒密切相关，我们可以将其视为真正的祖先。” 　  （来源：中国生物技术网） 原文出处：Smriti Mallapaty. Coronaviruses closely related to the pandemic virus discovered in Japan and Cambodia[J].Nature. 23 NOVEMBER 2020. 链接：https://www.nature.com/articles/d41586-020-03217-0
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