《基因组分析显示,许多动物物种可能易受SARS-CoV-2感染》

  • 来源专题:生物安全网络监测与评估
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2020-08-27
  • 根据加州大学戴维斯分校的一项新研究,人类并不是唯一面临SARS-CoV-2潜在威胁的物种。SARS-CoV-2是导致COVID-19的新型冠状病毒。

    一个国际科学家团队利用基因组分析,比较了该病毒在410种不同脊椎动物(包括鸟类、鱼类、两栖动物、爬行动物和哺乳动物)体内的主要细胞受体——血管紧张素转换酶-2 (ACE2)。

    ACE2通常存在于许多不同类型的细胞和组织中,包括鼻、口和肺的上皮细胞。在人体中,ACE2蛋白的25个氨基酸对病毒的结合和进入细胞非常重要。

    研究人员使用了ACE2蛋白的25个氨基酸序列,并将其预测的蛋白质结构与SARS-CoV-2刺突蛋白建模,以评估在不同物种的ACE2蛋白中发现了多少这些氨基酸。

    这篇论文的第一作者、加州大学戴维斯分校的博士后研究助理Joana Damas说:“所有25个氨基酸残基与人类蛋白质相匹配的动物,预计通过ACE2感染SARS-CoV-2的风险最高。”“预计该物种的ACE2结合残留物与人类的差异越大,风险就会降低。”

    大约40%可能对SARS-CoV-2敏感的物种被国际自然保护联盟列为“受威胁”物种,可能特别容易受到人-动物传播的伤害。这项研究发表在8月21日的《美国国家科学院院刊》上。

    该研究的主要作者、加州大学戴维斯分校(UC Davis)进化与生态学的著名教授哈里斯·卢因(Harris Lewin)说:“这些数据为识别易受感染和面临SARS-CoV-2感染风险的动物种群提供了一个重要的起点。”“我们希望它能启发人们在大流行期间保护动物和人类健康的做法。”

    濒危物种预计将面临危险

    一些极度濒危的灵长类物种,如西部低地大猩猩、苏门答腊猩猩和北部白颊长臂猿,预计它们通过ACE2受体感染SARS-CoV-2的风险非常高。

    其他被标记为高风险的动物包括海洋哺乳动物,如灰鲸和宽吻海豚,以及中国仓鼠。

    家畜如猫、牛和羊的风险为中等,狗、马和猪与ACE2结合的风险较低。这与感染和疾病风险之间的关系需要未来的研究来确定,但对于那些已知的传染性数据的物种来说,相关性是很高的。

    在记录在案的貂、猫、狗、仓鼠、狮子和老虎感染SARS-COV-2的病例中,病毒可能使用ACE2受体,也可能使用ACE2以外的受体进入宿主细胞。较低的结合倾向可转化为较低的感染倾向,或感染一旦形成,在动物体内或动物之间传播的能力较低。

    由于动物有可能从人类身上感染这种新型冠状病毒,反之亦然,包括国家动物园和圣地亚哥动物园在内的机构都为这项研究提供了基因组材料,因此加强了保护动物和人类的项目。

    “人畜共患疾病,如何预防人类动物传播并不是一个新挑战,动物园和动物保健专业人员,”合著者Klaus-Peter说Koepfli,高级研究科学家Smithsonian-Mason学院的保护和史密森保护生物学研究所前保护生物学家中心的物种生存和保护基因组学中心。“这些新信息让我们能够集中精力,制定相应计划,确保动物和人类的安全。”

    这组作者强烈建议不要根据计算结果对动物的预测风险进行过度解释,并指出实际的风险只能通过额外的实验数据来证实。动物的名单可以在这里找到。

    研究表明,SARS-CoV-2的直系祖先可能起源于一种蝙蝠。研究发现,蝙蝠通过ACE2受体感染新型冠状病毒的风险非常低,这与实际实验数据一致。

    蝙蝠是直接将新型冠状病毒传染给人类,还是通过中间宿主传播尚不清楚,但这项研究支持了一个或多个中间宿主参与其中的观点。这些数据使研究人员能够确定哪些物种可能在野生环境中充当中间宿主,帮助控制未来在人类和动物种群中爆发的SARS-CoV-2感染。

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  • 《PNAS:新研究揭示许多动物物种可能易受SARS-CoV-2感染》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-08-27
    • SARS-CoV-2是导致COVID-19的新型冠状病毒。在一项新的研究中,来自美国加州大学戴维斯分校等研究机构的研究人员发现人类并不是唯一面临SARS-CoV-2潜在威胁的物种。他们通过基因组分析比较了这种病毒在人体中的主要细胞受体---血管紧张素转换酶-2(ACE2)---在410种不同种类的脊椎动物中的作用,包括鸟类、鱼类、两栖类、爬行类和哺乳动物。相关研究结果于2020年8月21日在线发表在PNAS期刊上,论文标题为“Broad host range of SARS-CoV-2 predicted by comparative and structural analysis of ACE2 in vertebrates”。 ACE2通常存在于许多不同类型的细胞和组织中,包括鼻子、口腔和肺部中的上皮细胞。在人类中,ACE2蛋白的25个氨基酸是这种病毒结合并进入宿主细胞的重要条件。 这些作者利用人ACE2蛋白的这25个氨基酸序列,并将它的预测蛋白结构与SARS-CoV-2刺突蛋白一起建模,以评估不同物种的ACE2蛋白中存在多少这样的氨基酸。 论文第一作者、加州大学戴维斯分校博士后研究助理Joana Damas说,“预测具有与人ACE2蛋白相匹配的全部25个氨基酸残基的动物通过ACE2感染SARS-CoV-2的风险最高。预测物种的ACE2结合氨基酸残基与人类的差异越大,风险就越小。” 在可能对SARS-CoV-2敏感的物种中,约有40%的物种被国际自然保护联盟(International Union for Conservation of Nature)列为“濒危物种(threatened species)”,可能特别容易在人类与动物之间传播。 论文通讯作者、加州大学戴维斯分校进化与生态学教授Harris Lewin说,“这些数据为鉴定有感染SARS-CoV-2风险的易感动物群体和濒危动物群体提供了一个重要的起点。我们希望它能激发在大流行期间保护动物和人类健康的做法。” 经预测濒危物种将面临风险 一些极度濒危的灵长类物种,比如西部低地大猩猩、苏门达腊猩猩和北部白颊长臂猿,预计通过它们的ACE2受体感染SARS-CoV-2的风险非常高。其他被列为高危的动物包括灰鲸和宽吻海豚等海洋哺乳动物,以及中国仓鼠。 猫、牛和羊等家养动物被发现具有中等风险,而狗、马和猪被发现具有结合ACE2的低风险。这与感染和疾病风险的关系如何,需要在未来的研究中加以确定,但对于那些有已知感染性数据的物种而言,这种相关性很高。 在记录的水貂、猫、狗、仓鼠、狮子和老虎感染SARS-COV-2的病例中,这种病毒可能使用它们的ACE2受体,或者它们可能使用ACE2以外的受体进入宿主细胞。较低的ACE2结合倾向可能转化为较低的感染倾向,或者一旦建立了感染,在动物体内或动物之间传播的能力较低。 由于动物有可能从人类身上感染这种新型冠状病毒,反之亦然。包括美国国家动物园和圣地亚哥动物园在内的研究机构都为这项研究贡献了基因组材料,而且已经加强了保护动物和人类的计划。 论文共同作者、美国国家动物园史密松-梅森保护学院高级研究科学家Klaus-Peter Koepfli说,“人畜共患疾病以及如何预防人畜共患疾病的传播对动物园和动物护理专业人员来说并不是一个新的挑战。这些新信息使得我们能够集中精力并制定相应的计划,以保证动物和人类的安全。” 这些作者敦促谨慎对待根据这些计算结果过度解释预测的动物风险,并指出实际风险只能通过额外的实验数据来确认。 已有研究表明SARS-CoV-2的直系祖先很可能起源于蝙蝠。人们已发现蝙蝠通过它的ACE2受体感染这种新型冠状病毒的风险非常低,这与实际实验数据一致。 目前并不知道蝙蝠是将这种新型冠状病毒直接传播给人类,还是通过中间宿主传播,但是这项研究支持了一个或多个中间宿主参与其中的观点。这些数据允许科学家们着重关注哪些物种可能作为野生的中间宿主,从而协助努力控制未来在人类和动物群体中爆发的SARS-CoV-2感染。
  • 《SARS-CoV-2感染犬的实验研究》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-05-21
    • 中国香港特别行政区政府渔农自然护理署在Nature发表论文“Infection of dogs with SARS-CoV-2”。2019年12月,SARS-CoV-2在武汉爆发,引起了流行性呼吸道疾病COVID-19。然而,SARS-CoV-2对宠物的易感性报道较少。 在香港特区的15例COVID-19病例的家庭中,发现有2条宠物狗被感染。文章通过RT-PCR、血清学、病毒基因组测序等技术对病毒进行了分离。此外,文章从一只受感染的德国牧羊犬中也分离出病毒。将两个犬来源病毒的基因序列与人类病例中检测到的病毒序列进行比对,结果显示序列相同,且动物在检疫期间保持无症状。研究表明,这些是SARS-CoV-2的人-动物间传播的实例。目前尚不清楚感染的狗是否可以将病毒传播给其他动物或人类。