3月13日_杭州某轻度COVID-19患者的病毒株代表的SARS-CoV-2中与弗林蛋白酶切割位点有关的进化新趋势
1.时间:2020年3月13日
2.机构或团队:浙江大学,杭州医学院
3.事件概要:
medRxiv预印平台于3月13日发表了浙江大学等的题为“Virus strain of a mild COVID-19 patient in Hangzhou representing a new trend in SARS-CoV-2 evolution related to Furin cleavage site”的文章。
研究人员发现,与武汉市相比,浙江省的788例确诊的COVID-19患者中,重症/危重型病毒的发病率降低,肝/肾损伤增加,核酸检测阳性时间延长。研究人员为了探明其机制,在轻度COVID-19患者中分离出了一株SARS-CoV-2(ZJ01),并通过基因比对发现了35个特异性基因突变的存在。进一步的系统发育分析和RSCU热图结果表明,ZJ01可能是SARS-CoV-2的潜在进化分支。研究人员根据8824和28247位点的碱基(C或T)对全球54个病毒株(C/T类型)进行了分类。研究人员发现ZJ01在这两个位置均为T,成为目前世界上唯一鉴定出的TT类型。此前,对弗林蛋白酶切割位点(FCS)的预测和病毒家族的序列比对表明,FCS可能是冠状病毒进化的重要位点。ZJ01在FCS(F1-2)附近存在突变,导致S蛋白表面的结构和静电分布发生变化,进一步影响了弗林蛋白酶的结合能力。研究人员单细胞测序和ACE2-Furin共表达的结果证实,整个人体内,尤其是在腺体、肝脏、肾脏和结肠中,Furin的含量较高,而FCS可能有助于SARS-CoV-2感染这些器官。而SARS-CoV-2向FCS形成的进化模式可能导致其临床症状更接近HKU-1和OC43(FCS序列-PRRA序列的来源)引起的流感,进一步显示了分化为轻度COVID-19亚型的潜力。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。
4.附件:
原文链接:https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.10.20033944v1