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《软件为你发现研究》

  • 来源专题：集成电路
  • 编译者： Lightfeng
  • 发布时间：2016-12-25

  • 寻找文件中的意义，以及与此相关的一切，现在可以用一个免费的在线工具来完成：Omnity。以前一个企业唯一的工具，需要花费数千美元只是为了使用它，新的免费在线版本确定了任何你所拖放的文件的意义，然后拿它和超过1.5千万兆字节的公共文件相比较——包括工程技术——和返回他们的关系图。

    联合创始人和首席执行官（CEO）Brian Sager告诉记者：“Omnity使用语义来找到99%的那些文件没有被引用连接，今天人们只能找到他们应该引用文件的1%。”

    “在大多数文档中，英语中最热门的10个词使用了大约25%的时间。前100名最流行的词使用了50%的时间。前7000个词使用了90%的时间，几乎包括了所有的动词和形容词，剩下的10%就留给了专业名词。”

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相关报告

  • 《研究发现电场可以产生弧线球》
    • 来源专题：纳米科技
    • 编译者：郭文姣
    • 发布时间：2020-05-28
    • 这一发现是基于电动力学的现象，即马格努斯效应。Zachary Sherman PhD ' 19，他现在是德克萨斯大学奥斯汀分校的博士后，麻省理工学院化学工程教授James Swan在本周发表于《物理评论快报》的一篇论文中描述了这一新现象。 马格努斯效应使旋转的物体被拉向垂直于其运动的方向，如在曲球中;它以空气动力为基础，在宏观尺度下运作——也就是在容易看到的物体上——而不是在更小的粒子上。这种由电场引起的新现象可以将粒子推进到纳米级别，使它们在一个可控的方向上移动，而不需要任何接触或移动部件。 这一发现令人惊讶，因为谢尔曼当时正在测试一些新的模拟软件，以模拟他正在开发的微型纳米粒子在磁场和电场中的相互作用。他所研究的试验案例包括将带电粒子置于电解液中，电解液是一种含有离子或带电原子或分子的液体。 他说，人们已经知道，当直径只有几十到几百纳米的带电粒子被置于这种液体中时，它们会保持悬浮在液体中，而不是沉降，形成胶体。然后离子聚集在粒子周围。新软件成功地模拟了这种离子聚类。接下来，他模拟了穿过材料的电场。这可能会引发一种称为电泳的过程，它将推动粒子沿着应用场的方向前进。软件再次正确地模拟了这个过程。 然后谢尔曼决定进一步推进，逐渐增加电场的强度。“但后来我们看到了一件有趣的事情，”他说。“如果电场足够强，你就能得到正常的电泳，但胶体会自发地开始旋转。”这就是马格努斯效应发挥作用的地方。 他说，在模拟中，不仅粒子在移动过程中旋转，而且“这两个运动耦合在一起，旋转的粒子就会偏离轨道”。“这有点奇怪，因为你向一个方向施加一个力，然后物体就会向你指定的方向垂直(直角)移动。他说，这与旋转球的空气动力学原理直接类似。“如果你在棒球中投掷一个曲球，它会朝着你投掷的方向前进，但随后它也会转向。所以这是著名的宏观马格努斯效应的微观版本。” 当电场足够强时，带电粒子在垂直于电场的方向上产生了强烈的运动。他说，这可能是有用的，因为有了电泳，“粒子会向其中一个电极移动，你会遇到这个问题，粒子会移动，然后它会进入电极，它会停止移动。”所以仅靠电泳是不能产生连续运动的。” 相反，由于这种新效应与应用领域成直角，它可以用来推动粒子沿微通道，只需在顶部和底部放置电极。他说，这样一来，粒子就会“沿着通道移动，永远不会撞上电极。”他说，这使得它“实际上是一种更有效地引导微观粒子运动的方法”。 他说，有两种不同类型的过程可以让这种能力派上用场。一种方法是使用粒子将某种“货物”运送到特定的地点。例如，微粒可以附着在治疗药物上，“你试图把它送到需要药物的目标位置，但你不能直接把药物送到那里，”他说。或者粒子可能含有某种化学反应物或催化剂，需要被引导到特定的通道以进行所需的反应。 另一个例子与这个过程相反:拿起一些目标材料，把它带回来。例如，产生一种产品的化学反应也可能产生许多不需要的副产品。“所以你需要一种方法来推出产品，”他说。这些粒子可以用来捕获产品，然后使用应用的电场提取。“在这种情况下，它们就像小吸尘器一样，”他说。“他们拿起你想要的东西，然后你可以把它们搬到其他地方，然后在更容易收集的地方发布产品。” 他说，这种效应应该适用于各种颗粒大小和颗粒材料，研究小组将继续研究不同的材料特性如何影响这种效应的旋转速度或平移速度。只要粒子和悬浮其中的液体的电学性质(称为介电常数)不同，这一基本现象几乎适用于它们的任何材料组合。 研究人员观察了介电常数非常高的材料，比如金属粒子，悬浮在低导电性的电解液中，比如水或油。谢尔曼说，在介电常数方面，“但你也可以在任何两种有对比的材料上看到这一点”，例如，在两种不混合的油中，就会形成悬浮的液滴。 这项工作得到了NASA和美国国家科学基金会的支持。
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  • 《Nature：新研究发现9种新的冠状病毒》
    • 来源专题：生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者：hujm
    • 发布时间：2022-02-20
    • 在一项新的研究中，来自加拿大、法国、俄罗斯、西班牙、美国和德国的研究人员重新分析了所有公开的RNA测序数据，发现了比以前已知的RNA病毒多出近10倍的病毒，包括在一些意想不到的地方发现的几种新的冠状病毒。这个全球规模的RNA病毒数据库可以帮助快速识别病毒外溢到人类，以及那些影响牲畜、作物和濒危物种的病毒。相关研究结果于2022年1月26日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery”。论文通讯作者为加拿大独立研究员Artem Babaian博士。 Babaian博士是Serratus项目合作的幕后推手。Babaian说，与云创新中心（加拿大英属哥伦比亚大学和亚马逊网络服务之间的公共/私人合作）合作，Serratus项目能够在亚马逊网络服务上建立一台“极其强大”的超级计算机，其功率相当于22500个CPU。 这台超级计算机读取了来自世界各地570万个生物样本的2000万GB（gigabyte, 千兆字节）的公开基因序列数据，寻找表明存在RNA病毒的特定基因。这些样本已经收集了13年，并在世界研究界内自由分享，包括从冰芯样本到动物粪便的一切样本。 Serratus项目的研究人员发现了132000种RNA病毒（以前只知道15000种）和9种新的冠状病毒。Babaian估计，如果没有云创新中心和亚马逊网络服务，传统的超级计算机需要花费一年多的时间和几十万美元来完成这项分析所需的2000年的CPU时间。Serratus项目在11天内花费24000美元完成了这一任务。 Babaian说，“我们正在进入一个了解自然界中病毒的遗传和空间多样性的新时代，以及各种各样的动物如何与这些病毒接触。我们希望是如果像SARS-CoV-2---导致COVID-19的冠状病毒---之类的病毒再次出现，我们不会措手不及。这些病毒可以更容易地被识别，并且可以更快地找到它们的天然病毒库。真正的目标是这些感染被及早识别，以至于它们永远不会成为大流行病。如果一名病人出现不明原因的发烧，一旦对血液进行测序，你如今可以将人类中的未知病毒与现有病毒的更大数据库联系起来。例如，如果一名病人在圣路易斯市出现了来源不明的病毒感染，你如今可以在大约两分钟内通过这种数据库进行搜索，并将这种病毒与例如2012年在撒哈拉以南非洲取样的一只骆驼联系起来。” 32岁的Babaian之前一直在加拿大英属哥伦比亚省癌症研究中心进行癌症基因研究，当COVID-19大流行病发生时，他转换了研究方向。Babaian说，这项新的研究是作为一个“有趣的副业”开始的，始于2020年3月3日，当时他和他的登山伙伴朋友---英属哥伦比亚大学工程系学生Jeff Taylor---“在一张餐巾纸的背面”勾勒出了这个想法。他指出，“我应该保留那张餐巾纸。” Babaian不久后向英属哥伦比亚大学的云创新中心（Cloud Innovation Centre）寻求帮助。Serratus项目，以英属哥伦比亚省Tantalus山脉的Serratus山命名，他和Taylor在2020年的一次攀登中看到了这座山，于是发起了这个项目。 Babaian回忆说，当第一批研究结果开始在他的笔记本电脑上闪现时，他正坐在他妻子的护理椅上，这表明Serratus项目不仅在工作，而且以几乎难以理解的速度产生数据。 他说，“这可能是我生命中最激动人心的科学时期。有两种类型的乐趣。第一类是微笑和开玩笑。第二类是当你在做这件事的时候很痛苦，但记忆却很闪亮，就像攀岩。在许多方面，Serratus项目是第二类乐趣。你只需要相信它会成功。” Babaian说，如果没有英属哥伦比亚大学云创新中心的支持，他不可能完成这项研究。他说，“云创新中心确实在那里为我们打开了大门。我们有一个想法，他们从他们的网络中带来了专家，使其成为现实。如今，全球社会可以从所有这些以前未被利用的研究中受益。” 英属哥伦比亚大学云创新中心主任Marianne Schroeder说，“Babaian带着一个创新的愿景找到了我们。英属哥伦比亚大学云创新中心的力量在于，我们将英属哥伦比亚大学的内部创新和技术团队与亚马逊网络服务的团队配对。我们非常荣幸能够支持这一愿景的实现；协助为复杂问题找到技术解决方案是我们的工作。” 参考资料： Robert C. Edgar et al. Petabase-scale sequence alignment catalyses viral discovery. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-021-04332-2.
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