沙尔达大学的研究人员在ChemRxiv预印版平台发表论文“Targeting Novel Coronavirus 2019: A Systematic Drug Repurposing Approach to Identify Promising Inhibitors Against 3C-like Proteinase and 2'-O-Ribose Methyltransferase”。
鉴于3C样蛋白酶(3CLpro)和2'-O-核糖甲基转移酶(2'-O-MTase)在病毒生命周期中的重要作用,研究选择了两种药物靶点。3CLpro是一种半胱氨酸蛋白酶,负责复制酶多蛋白的蛋白水解,形成各种功能蛋白,而2'-O-MTase使病毒mRNA的第一和第二核苷酸的核糖2'-O位置甲基化,从而将其从宿主免疫系统中分离出来。针对123种抗病毒药物的内部文库筛选了选定的药物靶蛋白。根据结合自由能的估计值(ΔG),药物分子在活性部位的取向和相互作用的残基,为每种蛋白质鉴定出两种有前途的药物分子。然后将所选的蛋白质-药物复合物进行MD模拟,该模拟包括各种结构参数,以等效地反映其生理状态。从虚拟筛选结果中,为每个药物靶蛋白选择两个药物分子[对3CLpro和对2'-OMTase分别为帕利瑞韦(ΔG=-9.8 kcal/mol)和拉替拉韦(ΔG=-7.8 kcal/mol)和比卡格韦(ΔG=-8.4 kcal/mol)]。经过广泛的计算分析后,研究人员提出拉替拉韦、帕利瑞韦、比卡格韦和度鲁特韦是这些关键蛋白质的优秀潜在候选药物,它们可能成为对抗2019-nCoV的潜在治疗药物。
*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。