口蹄疫(FMD)报告不足掩盖了该疾病的真实流行情况。用于检测FMD病毒(FMDV)的实验室检测通常依赖于仅能从急性感染的动物收集的囊泡上皮和液体样品的收集,因此可能无法鉴定具有亚临床感染的动物。牛奶是一种非侵入性样本类型,通常从奶牛场收集,用于监测许多其他疾病。本研究的目的是检验牛奶作为FMDV检测和分型的替代样品类型的应用,并评估牛奶作为东非FMD靶向监测的新方法。在坦桑尼亚北部从天然感染的牛中采集的73/190(38%)个体牛奶样本中检测到FMDV RNA。此外,对于58%的阳性样品,获得了通过谱系特异性rRT-PCR测定的分型信息,并且与研究区域中的暴发调查期间鉴定的病毒类型相对应。从乳样品获得的VP1编码序列数据对应于从相同动物收集的配对上皮样品产生的序列数据。该研究表明,牛奶代表了FMDV监测的潜在有价值的样本类型,可能用于克服传统监测方法的一些现有偏见。但是,建议在样品采集和测试过程中注意尽量减少交叉污染的可能性。这些方法可以加强东非的口蹄疫病毒监测能力,包括个体动物和畜群。