《Nature:揭示人体产生的蛋白viperin抑制HIV、HCV、寨卡病毒等多种病毒的作用机制》

  • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
  • 编译者: hujm
  • 发布时间:2018-06-22
  • 抗病毒蛋白viperin是人类和其他哺乳动物体内的一种天然存在的酶。已知它对包括西尼罗河病毒、丙型肝炎病毒(HCV)、狂犬病病毒和HIV在内的许多病毒具有抗病毒作用。在一项新的研究中,来自美国阿尔伯特-爱因斯坦医学院、宾夕法尼亚州立大学和波士顿蛋白质创新研究所的研究人员鉴定出viperin的抗病毒作用机制。这种酶促进三磷酸胞苷(CTP)产生3’-脱氧-3’,4’-二脱氢-CTP(3?-deoxy-3′,4?-didehydro-CTP, ddhCTP)分子。ddhCTP阻止病毒复制它们的遗传物质,因而阻止它们增殖。这一发现可能允许人们开发出诱导人体产生这种分子的药物,并且这些药物可能作为广谱抗病毒疗法加以使用。相关研究结果于2018年6月20日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“A naturally occurring antiviral ribonucleotide encoded by the human genome”。

    论文共同作者、宾夕法尼亚州立大学的Craig Cameron教授说,“我们已知viperin通过某种酶活性具有广泛的抗病毒作用,但是其他的抗病毒剂使用不同的方法来阻止病毒。由论文通信作者Tyler Grove和Steven Almo领导的阿尔伯特-爱因斯坦医学院合作者们揭示出viperin催化一种重要的反应,从而导致ddhCTP分子产生。我们在宾夕法尼亚州立大学的团队随后证实了ddhCTP对病毒复制其遗传物质的能力的抑制作用。令人吃惊的是,这种分子的作用方式类似于开发出的用于治疗HIV和HCV等病毒的药物。随着更好地理解viperin如何阻断病毒复制,我们希望能够设计出更好的抗病毒剂。”

    病毒通常会劫持宿主的遗传构成单元(building block)来复制它自身的遗传物质,并将核苷酸分子整合到新的RNA链中。这种ddhCTP分子模拟这些核苷酸构成单元,并被整合到病毒基因组中。这些“核苷酸类似物”一旦被整合到病毒的新RNA链中,就会阻止RNA聚合酶向这条RNA新链中添加更多的核苷酸,从而阻止病毒产生它的遗传物质的新拷贝。

    市场上销售的大多数核苷酸类似物都是人造的,但是使用这些合成药物往往会产生并发症。鉴于核苷酸被细胞中的许多蛋白和酶所使用,因此核苷酸类似物有很多机会来干扰正常的细胞功能。然而,与当前的许多药物不同的是,ddhCTP是由人类和其他哺乳动物的细胞编码的。分子ddhCTP似乎没有任何意想不到的靶标。因此,这些研究人员猜测这种化合物在人体内的天然来源使得它肯定是无毒的。

    为了验证ddhCTP的有效性,这些研究人员发现这种分子抑制登革热病毒、西尼罗河病毒和寨卡病毒中的RNA聚合酶,这些病毒都属于一组称为黄病毒的病毒。他们随后研究了这种分子是否阻止了寨卡病毒在活细胞中的复制。

    论文共同作者、宾夕法尼亚州立大学生物化学与分子生物学助理教授Joyce Jose说,“这种分子抑制三种不同的寨卡病毒毒株复制。它同样有效地抑制1947年的原始寨卡病毒毒株和2016年近期爆发流行病的两种寨卡病毒毒株。这是特别令人兴奋的,这是因为已知目前没有治疗寨卡病毒的药物。这项研究突出了针对ddhCTP等天然化合物的一个新的研究途径,这些天然化合物可能用于未来的治疗。”

    总之,这些结果表明ddhCTP对各种黄病毒具有有希望的抗病毒作用。然而,人鼻病毒和脊髓灰质炎病毒(属于细小RNA病毒)中的RNA聚合酶对ddhCTP并不敏感。这些研究人员计划研究这些病毒的RNA聚合酶结构,以便更好地理解为什么黄病毒对ddhCTP敏感,而这项研究中测试的细小RNA病毒对ddhCTP不敏感。这项研究还可能提供对黄病毒如何可能对这种分子产生抵抗性提供新的认识。

  • 原文来源:http://news.bioon.com/article/6723759.html
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  • 《抑制艾滋病病毒转录机制揭示》

    • 来源专题:生物安全知识资源中心 | 领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2020-08-28
    • 在某些未接受抗逆转录病毒治疗而能够控制病毒复制的艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者中,病毒经常整合到人类基因组的特定区域,其中的病毒转录受到抑制。这一,26日在线发表在英国《自然》杂志上。   只有不到0.5%的HIV-1感染者,能够保持对HIV的无药物控制。虽然在这些人体内存在的具备复制能力的病毒库,但一直以来科学家都不清楚这种无药物控制究竟是如何实现的。   美国麻省总医院、麻省理工学院和哈佛拉根研究所的研究团队,此次比较了64名保持HIV-1无药控制者的细胞和41名正在接受抗逆转录病毒治疗者的细胞中的前病毒(已整合到宿主细胞DNA中的病毒基因组)。研究人员发现,能实现无药控制的所谓“精英控制者”,其细胞中的前病毒数量中位数明显低于接受抗逆转录病毒治疗者的细胞。然而,在这些“无药精英控制者”的细胞中,有较大比例的前病毒序列基因是完整的。   研究团队利用染色体整合位点分析发现,在“无药精英控制者”中,病毒被整合到DNA的非蛋白编码区域或19号染色体上的KRAB-ZNF基因中。这些区域由紧密组合的DNA(称为异染色质)组成,通常不利于HIV-1整合。他们还发现,整合位点往往离宿主转录起始位点更远。研究人员认为,这种深层病毒休眠或潜伏在维持对HIV-1的无药控制方面有一定的作用,但他们指出,这一过程并非完全永久或不可逆转。   HIV治愈分两种,一种是清除性治愈,即一次性彻底完全清除体内所有HIV病毒;另一种则是功能性治愈,即抑制住HIV病毒复制,达到目前水平检测不出的状态。   研究团队在分析其中某一人的15亿多个外周血单核细胞时,无法从中检测到任何完整的前病毒序列。他们谨慎地认为,这个人可能已经实现了HIV的清除性治愈,这种效果以前只在造血骨髓移植后观察到过。   总编辑圈点   世界上第一位被成功治愈的艾滋病患者,是13年前著名的“柏林病人”,他接受了干细胞移植治疗,成为公认的功能性治愈艾滋病患者。目前,功能性治愈也是HIV治疗的重点,不过后续研究认为“柏林病人”虽然不是一个偶然事件,却也不适用于所有患者,而且当时的治疗过程也令“柏林病人”承受了巨大痛苦。而此次对无药控制者基因序列的详尽分析,或能为人们揭示其中的奥秘,从而为真正的清除性治愈带来希望。
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    • 来源专题:生物安全知识资源中心—领域情报网
    • 编译者:hujm
    • 发布时间:2022-10-21
    • 在一项新的研究中,来自美国宾夕法尼亚大学、德克萨斯大学医学部、波士顿大学和波士顿医学中心的研究人员发现SARS-CoV-2病毒会产生一种模拟包装DNA的蛋白的蛋白,从而阻止通常在免疫反应中发挥作用的转录。相关研究结果于2022年10月5日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“SARS-CoV-2 disrupts host epigenetic regulation via histone mimicry”。 在这篇论文中,这些作者描述了他们如何将包装人类DNA的蛋白---组蛋白---与SARS-CoV-2病毒产生的蛋白进行比较,以及这样做表明了什么。 瑞士伯尔尼大学的Lisa Thomann和Volker Thiel在同期Nature期刊上发表了一篇标题为“SARS-CoV-2 mimics a host protein to bypass defences”的新闻与观点类型文章,描述了这些作者在这项新的研究上所做的研究工作。 随着COVID-19大流行病的持续和减轻,科学家们继续研究导致COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2,他们关注的领域之一是这种病毒抑制受感染者的宿主细胞反应的非凡能力。在这项新的研究中,这些作者更仔细地观察了人类细胞中包装DNA的组蛋白和SARS-CoV-2产生的蛋白之间的关系。 先前的研究已表明,SARS-CoV-2产生三种主要类型的蛋白;参与复制的蛋白、参与结构过程的蛋白和辅助蛋白。 辅助蛋白参与了广泛的活动。先前的研究还表明,人类的DNA被包装在称为组蛋白的蛋白中---它们的作用是将DNA链固定在适当的位置,组蛋白的作用是将DNA链固定在适当的位置,并充当读取DNA链的蛋白(DNA读取蛋白)的守门员,DNA读取蛋白利用读取的DNA信息发挥功能,如向身体其他部位发送信号。当宿主被感染时,一些信号传导参与其中,以促使宿主防御机制对抗入侵的病原体。 在这项新的研究中,这些作者发现有证据表明,SARS-CoV-2病毒产生的一种辅助蛋白(ORF8)能够模拟至少一种包装DNA的组蛋白(KAT2A)。通过这样做,这种病毒抑制了宿主遭受感染时应该发生的那种信号传导,从而减少了宿主免疫反应。 参考资料: John Kee et al. SARS-CoV-2 disrupts host epigenetic regulation via histone mimicry. Nature, 2022, doi:10.1038/s41586-022-05282-z. Lisa Thomann et al. SARS-CoV-2 mimics a host protein to bypass defences. Nature, 2022, doi:10.1038/d41586-022-02930-2.