《与常见血管疾病相关的新基因组区域》

  • 来源专题:人类遗传资源和特殊生物资源流失
  • 编译者: yanyf@mail.las.ac.cn
  • 发布时间:2019-11-05
  • 静脉血液凝结是一种常见的血管疾病,如心脏病发作和中风,是一种称为静脉血栓栓塞症(VTE)的疾病,但尚未得到充分研究。已知涉及遗传,但是只有大约十二个基因组区域与该病有关。现在,由麻省理工学院和哈佛大学,马萨诸塞州总医院(MGH)和美国退伍军人事务部(VA)波士顿医疗系统的研究人员领导的一项有关VTE的大型基因研究,发现了基因组中的22个新区域这种病。研究小组还开发了一种遗传评分,有一天可以用来识别患该病最高风险的患者。

    一种更准确的预测谁的风险更高的方法可以更好地确保只有风险最高的患者才能接受VTE的预防性治疗,即血液稀释药物,这种药物可能使患者容易发生大量出血。

    这项研究发表在2019年11月的《自然遗传学》上,分析了超过65万人的遗传数据,发现基因组中的33个位置(其中22个以前未知)可能在该疾病中起作用。研究小组还揭示了与其他形式的血管疾病的某些遗传重叠,这一见解可以帮助引发新的,更安全的治疗方法的开发。

    资深作者Pradeep Natarajan说:“就我们研究的个体的数量和多样性以及与VTE相关的遗传变异数量而言,我们的研究代表了VTE遗传发现方面的重要一步。” Broad Institute的副会员,MGH的预防心脏病学主任。

    在静脉中潜伏

    在VTE中,血液凝块通常在腿部的深静脉中形成。然后,如果它们通过血液流向肺部,它们可能会移位并可能致命。吸烟,癌症,怀孕,久坐不动以及近期住院均与VTE有关。仅在美国,每年就有超过500,000名住院成年人患上这种疾病。

    先前的研究发现了少数与VTE相关的遗传变异。特别是两种-一种在凝血因子V的凝血因子基因中,另一种在凝血酶原基因中-每一种都会使VTE风险增加2到3倍,大约占总人口的1-3%。

    为了寻找更多的VTE基因组区域,Nataarajan和他的同事进行了全基因组关联研究(GWAS)。研究人员包括Broad研究机构,VA波士顿医疗保健系统,马萨诸塞州总医院和佛罗里达大学医学院的第一作者Derek Klarin,以及下士Michael Crescenz VA医疗中心和医学博士的共同资深作者Scott Damrauer。宾夕法尼亚大学佩雷??尔曼医学院的研究来自两个大型生物库的数据:英国生物库和百万老兵计划。他们的初步分析涉及大约1300万个DNA变异和650,00个人,包括VTE患者和健康对照。为了验证他们的发现,研究人员还使用了第三批来自VTE患者的180,000多个样本和来自INVENT联盟的无病对照。

    在新发现的与VTE相关的基因组区域中,许多位于与凝血相关的基因内或附近。其他地区的角色未知。

    风险预测

    为了试图预测谁将更可能发展为VTE,研究人员开发了一个多基因风险评分,他们根据将近300个遗传变异造成的风险进行了计算。他们从计算中排除了因子V和凝血酶原基因中已知的VTE危险因素,以查看他们是否可以根据遗传易感性识别出更多的高危患者。然后,该团队使用“百万老兵计划”和“妇女健康计划”的其他数据测试了该分数。

    多基因评分将5%的研究人群标记为VTE风险增加了2到3倍。这些人群的风险水平与因子V莱顿或凝血酶原突变的人群相似,但代表的人群更大,这表明多基因评分可能比目前的方法将更多的患者确定为VTE的遗传高危患者。

    Natarajan强调,他的团队的多基因评分是一种研究工具,需要进一步研究才能用于临床。

    他和他的同事还发现,与VTE相关的某些遗传变异与与其他血管疾病(如冠状动脉疾病,外周动脉疾病和中风)相关的遗传变异相同。这一发现可能解释了为什么在一些他汀类药物临床试验的二次分析中已显示出有效降低心脏病风险的称为他汀类药物的降低LDL胆固醇的药物可降低VTE风险。

    纳塔拉然说:“我认为这里有一个重要的机会,可以用于未来的工作,尤其是与所有这些条件重叠的遗传变异,可以开发出对多种疾病有效的最大有效疗法。” “这可能涉及抗凝作用,甚至可能涉及降低LDL胆固醇等更安全的策略。”

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