组学技术可以对溶解代谢物和微生物实现识别监测,在量化珊瑚礁生态系统研究中显示出可观前景。
伍兹霍尔海洋研究所应用了四种组学技术(扩增子测序散弹枪元基因组学、靶向代谢组学和非靶向代谢组学)对佛罗里达珊瑚礁上的水域进行分析,并对这些珊瑚礁的单个珊瑚群落进行微生物组分析,通过微生物和溶解代谢物认识大堡礁的生物地理、底栖和营养特性。结果表明,微生物组学和代谢物组学方法可根据地理区域区分不同的珊瑚礁栖息地。此外,与元基因组测序和非靶向代谢组学相比,海水微生物组剖析和靶向代谢组学更能体现珊瑚礁生境特征。在五个珊瑚物种中,微生物组与珊瑚礁区域也有显著关系,其次是物种和疾病状态,这表明佛罗里达州的水循环模式也影响着珊瑚礁建造者的微生物组。差异丰度和指示物种分析相结合,揭示了特定珊瑚礁区的代谢物和微生物特征,表明这些技术可为珊瑚礁微生物和代谢物特征提供新的见解,从而反映更广泛的生态系统过程。(熊萍 编译)