3月2日，bioRxiv预印本发表了来自波兰西里西亚理工大学、加拿大埃德蒙顿艾伯塔大学的题为“Molecular Dynamics Simulations Indicate the COVID-19 Mpro Is Not a Viable Target for Small-Molecule Inhibitors Design”的文章。
2019年12月爆发的新型冠状病毒继续在全球迅速传播。在缺乏有效疫苗的情况下，抑制剂再利用或从头设计可能提供了一个对抗这种和未来由类似病毒引起的感染的策略。在此，文章报告了主要蛋白酶Mpro的详细分子动力学模拟。作者将COVID-19的Mpro与高度相似的SARS蛋白进行了比较，发现尽管序列相似性很高，但两种蛋白的活性位点在形状和大小上都显示出重大差异，这表明将SARS药物用于COVID-19可能是徒劳的。此外，对pocket的时间依赖性分析表明了SARS-CoV-2病毒的灵活性和可塑性，这使快速可靠的药物设计的希望破灭。相反，蛋白质在柔性环突变方面的结构稳定性表明病毒的易变性将对小分子抑制剂的合理设计提出进一步的挑战。
