2023年12月7日，伦敦大学等机构的研究人员在Cell上发表了题为Trellis tree-based analysis reveals stromal regulation of patient-derived organoid drug responses的文章。
患者来源的类器官(PDO)可以模拟个性化治疗反应; 然而，目前的筛选技术不能揭示药物反应机制或肿瘤微环境细胞如何改变治疗性能。
为了解决这个问题，该研究开发了一个高度复用的质量细胞术平台来测量 > 2500个大肠癌(CRC) pDO 和癌症相关成纤维细胞(caf)中的翻译后修饰(PTM)信号传导，DNA 损伤，细胞周期活性和细胞凋亡，以响应单细胞分辨率的临床治疗。
为了比较数千个单细胞数据集中患者和微环境特异性药物反应，研究人员开发了“网格”ー一种高度可扩展的、基于树的治疗效果分析方法。格状单细胞筛选显示靶细胞周期阻断和 DNA 损伤药物效应是常见的，甚至在难化疗的 PDO 中也是如此。然而，药物诱导的细胞凋亡是罕见的，患者特异性并与癌细胞 PTM 信号一致。研究人员发现 CAFs 可以调节 PDO 的可塑性，即将增殖性结肠干细胞(proCSCs)转变为缓慢循环的复苏性结肠干细胞(revCSCs) ，以保护癌细胞免受化疗的伤害。
