《欧盟/欧洲经济区中SARS-CoV-2变体的检测和表征能力》

  • 来源专题:动植物疫病
  • 编译者: 刘小燕
  • 发布时间:2021-06-23
  • 欧洲疾病预防控制中心(ECDC)已映射了整个EU / EEA中SARS-CoV-2变体的检测和表征能力。这是自2019年12月COVID-19大流行开始以来的第五次实验室能力调查。

    关键信息:

    1.在大多数成员国中,用于识别SARS-CoV-2变体的测序能力低于欧洲委员会设定的对5-10%的SARS-CoV-2阳性样本进行测序的建议。

    2.尽管大多数欧盟/欧洲经济区国家都在积极调查SARS-CoV-2变体的出现,但三个国家没有这样做。

    3.许多国家正在增加或计划增加其排序能力,但表示需要ECDC的支持。

    4.具体需求包括对测序能力和协议的支持,尤其是对生物信息学的支持。

    5.在许多国家/地区,与公共卫生部门共享的PCR预筛查结果的处理时间超过48小时。

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    • 在全世界范围内,由于进化和适应过程,病毒通过SARS-CoV-2病毒的突变和变异不断变化。虽然大多数新出现的突变不会对病毒的传播产生重大影响,但某些突变或突变组合可能会为病毒提供选择性优势,例如增加的可传播性或逃避宿主免疫反应的能力。在此更新中,我们报告有关三种病毒变体(VOC 202012 / 01、501Y.V2和变体P.1)传播的新信息。这些变体被认为是令人关注的,因为突变已导致在它们最近被建立的地区增加了传播性并恶化了流行病学状况。 VOC 202012/01最初于2020年12月在英国南部被确认为关注的对象。VOC202012/01的最早识别样品可追溯至2020年9月。从那时起,它成为主要的样品。在英国流通的变体。自2020年12月下半以来,其可传播性显着提高,导致发病率、住院和医疗系统压力增加。英国已实施更严格的非药物干预措施(NPI)以减少传播。初步研究表明,没有证据表明VOC 202012/01与明显不同的感染严重性相关,或者与以前传播的病毒相比,它对某些年龄组的影响更大。然而,由于发病率上升,到2021年1月,英国报告了自大流行开始以来每日最高的COVID-19死亡率。 变体501Y.V2于2020年12月在南非首次发现,现在是最流行的变体。初步结果表明,该变体还可能具有更高的透射率。但是,对于VOC 202012/01,在此阶段尚不确定501Y.V2变体是否引起疾病严重性的变化。截至2021年1月19日,已在10个欧盟/欧洲经济区国家中识别出501Y.V2。目前正在法国研究这种变体的一个簇。除法国外,以色列和英国还报告了与旅行无关的501Y.V2病例或群。欧盟/欧洲经济区确定的其余案件大多与旅行有关,而不仅仅是南非。 迄今为止,仅在巴西发现了P.1变体,日本和韩国报道了来自巴西(主要来自亚马逊州)的旅行者。亚马孙州的首都马瑙斯(Manaus)目前正在经历COVID-19病例激增,给医疗保健系统带来巨大压力。 ECDC估计,由于其可传播性的提高,在EU / EEA中引入关注的变体并在社区中传播的可能性非常高。这种增加的可传播性可能导致感染数量的增加。反过来,这很可能导致所有年龄组的住院率和死亡率更高,尤其是对于那些年龄较大或有合并症的人。因此,需要更严格的NPI来减少传播并缓解医疗保健系统的压力。也因此,关注的变种的引入和社区传播相关的总体风险被评估为高/非常高。 会员国应继续监测当地传播率或感染严重性的变化,以识别和评估变种的传播和影响。为了检测出已知变体的引入以及新变体的出现,需要提高对社区COVID-19病例代表性样本的监测和测序水平。同时由于关注的新变量的可传播性增加,也应为自己的医疗系统做好准备,以进一步扩大需求。
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