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《冠状病毒中涉及穿山甲病毒来源nCoV-2019的重组证据》

  • 来源专题：新发突发疾病（新型冠状病毒肺炎）
  • 编译者： 蒋君
  • 发布时间：2020-02-25

  • 对nCoV-2019的基因组分析确定其与2013年从蝙蝠中分离出的冠状病毒(RaTG13)相似度为96％，但是这两个基因组的受体结合基序(RBM)却具有较低的序列相似性。这种差异表明，nCoV-2019可能存在一个RBM编码序列的替代来源。我们检测到马来亚穿山甲重组冠状病毒基因组与新冠病毒在同一个 RBM 片段上具有 89% 的核苷酸和 98% 的氨基酸同源性。这一发现表明nCoV-2019的起源可能更为复杂，穿山甲可能是新型冠状病毒的中间宿主。

  • 原文来源：;https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2020/02/13/2020.02.07.939207.full.pdf
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    • 发布时间：2020-02-15
    • 2月13日_新型冠状病毒的重组证据暗示其宿主可能是穿山甲 1.时间：2020年2月13日 2.机构或团队：美国贝勒医学院、德克萨斯大学安德森癌症中心 3.事件概要： 美国贝勒医学院等于2020年2月13日在bioRxiv上发表题为“Evidence of recombination in coronaviruses implicating pangolin origins of nCoV-2019”的文章。 新型冠状病毒的基因组分析显示其与2013年从蝙蝠中分离的冠状病毒（RaTG13）有96%的相似性，但两个基因组的受体结合motif（RBM）具有较低的序列相似性。研究人员指出这种差异表明，新型冠状病毒中的RBM编码序列可能是另一种来源。研究人员在新型冠状病毒以及从穿山甲病毒宏基因组数据重建的冠状病毒基因组之间的RBM发现了高度相似序列，这表明nCoV-2019的起源可能更加复杂。 *注，本文为预印本论文手稿，是未经同行评审的初步报告，其观点仅供科研同行交流，并不是结论性内容，请使用者谨慎使用。 4.附件： 链接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.939207v1
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    • 2019年底在中国中部城市武汉爆发的2019-nCoV疫情给中国及世界其他地区带来了前所未有的公共卫生挑战。新的冠状病毒与SARS-CoV和新鉴定的蝙蝠冠状病毒具有高度的序列同一性。尽管蝙蝠可能是各种冠状病毒的宿主宿主，但2019-nCoV是否还有其他宿主仍然不清楚。在这项研究中，从马来亚穿山甲中分离出的一种冠状病毒在E，M，N和S基因中分别与2019-nCoV表现出100％，98.2％，96.7％和90.4％的氨基酸同一性。特别地，穿山甲-CoV的S蛋白的受体结合结构域实际上与2019-nCoV的S-受体结构域相同，只是具有一个氨基酸差异。现有基因组的比较表明，2019-nCoV可能起源于穿山甲CoV样病毒与Bat-CoV-RaTG13样病毒的重组。感染的穿山甲显示出临床症状和组织病理学变化。穿山甲中与2019-nCoV高度相关的冠状病毒的分离表明，这些动物有可能充当2019-nCoV的中间宿主。如果不能有效地控制野生动植物贸易，则在人口最多的哺乳动物中新发现的冠状病毒可能对公共健康构成持续威胁。
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